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제품소개

[BIO-RAD] 표준곡선 없이 가능한 절대정량, ddPCR의 핵심 원리

2026-06-18
ddPCR 대문 이미지
01
ddPCR이란?
ddPCR(Droplet Digital PCR)은 하나의 샘플을 수만 개의 미세한 droplet으로 분할한 뒤, 각 droplet 안에서 PCR 반응을 개별적으로 수행하고 그 결과를 디지털 신호로 읽어내는 정량 분석 시스템입니다.
• 기존 PCR이 하나의 반응에서 전체 샘플의 신호를 측정하는 방식이라면, ddPCR은 샘플을 약 20,000개의 독립적인 반응 단위로 분할하여 각 반응의 양성·음성 여부를 개별적으로 판별합니다.
구분
1세대
Conventional PCR
2세대
qPCR
3세대
       ddPCR
정량 방식 불가 상대 정량
(표준곡선 필요)
절대 정량
(표준곡선 불필요)
민감도 낮음 중간 높음
주요 용도 표적 유전자
유무 확인
유전자 발현 분석 정밀 정량이 필요한
모든 분야
(유전자 발현, 병원체,
GMO, ctDNA 등)
02
ddPCR의 workflow
ddPCR 실험은 크게 네 단계로 진행됩니다.
STEP
1
샘플 준비
DNA 샘플과 primer, ddPCR 전용 시약을 mix합니다.
Supermix의 detection 방식에 따라 Hydrolysis Probe(FAM, HEX/VIC) 방식과 Intercalating Dye(EvaGreen) 방식으로 나뉩니다.
STEP
2
Droplet 생성
반응액을 오일과 함께 카트리지에 주입해 약 20,000개의 균일한 water-in-oil 에멀전 droplet을 생성합니다.
각 droplet은 독립된 반응 공간이 됩니다.
STEP
3
PCR 증폭
Thermal cycler로 각 droplet 내 target 유전자를 증폭합니다.
PCR 반응이 완료된 후 endpoint에서 형광 신호를 측정하여 각 droplet의 양성·음성 여부를 판별합니다.
STEP
4
결과 판독
Droplet reader가 각 droplet의 형광 유무를 판독하고, Poisson 분포 보정으로 양성/음성 비율에서 copy number(copies/µL)를 자동 산출합니다.
신뢰성 있는 결과를 얻기 위해서는 일반적으로 10,000개 이상의 droplet이 확보되어야 합니다.
양성 음성 droplet 분포 및 Poisson 보정 개념
출처 : Bulletin_6407.pdf (Bio-Rad)
▲ 양성/음성 droplet 분포와 Poisson 보정 개념
03
ddPCR의 핵심 장점
절대 정량
표준물질이나 표준곡선 없이 유전자 절대량(copies/µL)을 직접 측정할 수 있습니다. 또한 Poisson 통계 기반의 분석을 통해 높은 정량 정확도와 재현성을 제공합니다.
높은 민감도
샘플을 수만 개의 droplet으로 분할해 분석함으로써 극소량의 target도 검출할 수 있습니다. 희귀 돌연변이, ctDNA, 저농도 바이러스 등 미량 분석이 필요한 연구에 적합합니다.
● 정확도·정밀도·재현성
균일하게 생성된 droplet을 기반으로 수만 개의 독립적인 PCR 반응을 수행하여 정량의 변동성을 줄입니다. 그 결과 높은 정확도(Accuracy), 정밀도(Precision), 재현성(Reproducibility)을 확보할 수 있습니다.
PCR 최적화 부담 감소
End-point 기반으로 분석하여 PCR 효율 변화의 영향을 상대적으로 적게 받으며, annealing 온도 조건이나 PCR inhibitor에 대한 내성이 높아 실험 조건 최적화 부담을 줄일 수 있습니다.
04
관련 제품 (장비)
분리형 시스템
단계별 장비를 조합해 워크플로 구성
· Droplet Generator (DG / Auto DG)
· Thermal Cycler (PTC / T100)
· Droplet Reader (QX200 / QX600)
분리형 시스템
올인원 시스템 추천추천
droplet 생성→증폭→판독→분석을 하나의 장비에서 자동 수행
· QX ONE
· QX Continuum
· QX700 (E / S / HT)
분리형 시스템
▲ ddPCR 장비 라인업 — 올인원 시스템과 분리형 시스템
※ 소모품 ddPCR 관련 시약은 ddPCR 전용 제품으로 사용하여야 합니다.
대표전화 1670-5911
www.seoulin.co.kr / slb@seoulin.co.kr
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