[BIO-RAD] 표준곡선 없이 가능한 절대정량, ddPCR의 핵심 원리
2026-06-18

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ddPCR이란?
• ddPCR(Droplet Digital PCR)은 하나의 샘플을 수만 개의 미세한 droplet으로 분할한 뒤, 각 droplet 안에서 PCR 반응을 개별적으로 수행하고 그 결과를 디지털 신호로 읽어내는 정량 분석 시스템입니다.
• 기존 PCR이 하나의 반응에서 전체 샘플의 신호를 측정하는 방식이라면, ddPCR은 샘플을 약 20,000개의 독립적인 반응 단위로 분할하여 각 반응의 양성·음성 여부를 개별적으로 판별합니다.
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| 구분 |
1세대
Conventional PCR
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2세대
qPCR
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3세대
ddPCR✓
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| 정량 방식 | 불가 | 상대 정량 (표준곡선 필요) |
절대 정량 (표준곡선 불필요) |
| 민감도 | 낮음 | 중간 | 높음 |
| 주요 용도 | 표적 유전자 유무 확인 |
유전자 발현 분석 | 정밀 정량이 필요한 모든 분야 (유전자 발현, 병원체, GMO, ctDNA 등) |
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ddPCR의 workflow
ddPCR 실험은 크게 네 단계로 진행됩니다.
![]() 출처 : Bulletin_6407.pdf (Bio-Rad)
▲ 양성/음성 droplet 분포와 Poisson 보정 개념 |
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ddPCR의 핵심 장점
● 절대 정량
표준물질이나 표준곡선 없이 유전자 절대량(copies/µL)을 직접 측정할 수 있습니다. 또한 Poisson 통계 기반의 분석을 통해 높은 정량 정확도와 재현성을 제공합니다.
● 높은 민감도
샘플을 수만 개의 droplet으로 분할해 분석함으로써 극소량의 target도 검출할 수 있습니다. 희귀 돌연변이, ctDNA, 저농도 바이러스 등 미량 분석이 필요한 연구에 적합합니다.
● 정확도·정밀도·재현성
균일하게 생성된 droplet을 기반으로 수만 개의 독립적인 PCR 반응을 수행하여 정량의 변동성을 줄입니다. 그 결과 높은 정확도(Accuracy), 정밀도(Precision), 재현성(Reproducibility)을 확보할 수 있습니다.
● PCR 최적화 부담 감소
End-point 기반으로 분석하여 PCR 효율 변화의 영향을 상대적으로 적게 받으며, annealing 온도 조건이나 PCR inhibitor에 대한 내성이 높아 실험 조건 최적화 부담을 줄일 수 있습니다.
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관련 제품 (장비)
▲ ddPCR 장비 라인업 — 올인원 시스템과 분리형 시스템
※ 소모품 ddPCR 관련 시약은 ddPCR 전용 제품으로 사용하여야 합니다.
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